Pathology pathologie - Digital Pathology - Revue canadienne de - Amazon S3

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Pathology pathologie - Digital Pathology - Revue canadienne de - Amazon S3
Canadian Journal of                         Volume 10 | Issue/numéro 3

pathology
pathologie            Revue canadienne de

 Digital Pathology

                                                                         Courtesy: Leica Biosystems

 PM 43490512

                            www.cap-acp.org
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KEYTRUDA:
Pr                                                                          ®

     NOW FOR PATIENTS
     WITH METASTATIC NSCLC
     WITH NO PRIOR SYSTEMIC
     CHEMOTHERAPY TREATMENT
     FOR METASTATIC NSCLC1

     NEW    NSCLC INDICATION                                                                              MELANOMA
     KEYTRUDA® (pembrolizumab) as monotherapy is indicated                                                KEYTRUDA® is indicated for the treatment
     for the treatment of metastatic NSCLC in adults whose                                                of patients with unresectable or metastatic
     tumours have high PD-L1 expression [Tumour Proportion                                                melanoma who have not received prior
     Score (TPS) ≥50%] as determined by a validated test, with                                            treatment with ipilimumab. Subjects with
     no EGFR or ALK genomic tumour aberrations, and no prior                                              BRAF V600 mutant melanoma may have
     systemic chemotherapy treatment for metastatic NSCLC.1                                               received prior BRAF inhibitor therapy.1

                                           Pembrolizumab is RECOMMENDED as
                                           a FIRST-line treatment of metastatic NSCLC,
                                           in patients with PD-L1+ expression ( TPS ≥50%)
                                           and EGFR-, ALK- in the NCCN guidelines.2
                                           Please see the NCCN guidelines for complete recommendations

 Clinical use:                                 • Other immune-mediated adverse events,                                   • Has not been studied in patients with
 Safety and efficacy of KEYTRUDA® in             including uveitis, arthritis, myositis, bullous                           moderate or severe hepatic impairment
 pediatric patients have not been established.   pemphigoid, myasthenic syndrome, vasculitis,                            • Has not been studied in patients with
                                                 Guillain-Barré syndrome, hemolytic anemia,                                severe renal impairment
 Relevant warnings and precautions:
                                                 pancreatitis, and partial seizures arising                              • Monitor liver and thyroid function tests
 • Immune-mediated adverse reactions             in a patient with inflammatory foci in                                    and electrolytes during treatment
   including:                                    brain parenchyma
     Pneumonitis                                                                                                         For more information:
                                                   Solid organ transplant rejection                                      Before prescribing KEYTRUDA®, please
     Colitis                                       Myocarditis
     Hepatitis                                                                                                           consult the product monograph available at
                                               • Severe infusion-related reactions, including                            https://health-products.canada.ca/dpd-bdpp/
     Nephritis and renal dysfunction             hypersensitivity and anaphylaxis
     Endocrinopathies including hypophysitis, • Embryofetal toxicity                                                     index-eng.jsp for important information
     type 1 diabetes mellitus and thyroid                                                                                relating to adverse reactions, drug interactions
                                               • Not recommended in pregnant women                                       and dosing information which have not been
     disorders                                 • In nursing women, a decision should be
     Severe skin reactions, including                                                                                    discussed in this document.
                                                 made whether to discontinue breast-feeding
     Stevens-Johnson syndrome and toxic          or KEYTRUDA® taking into account the                                    The product monograph is also available
     epidermal necrolysis                        benefit of breast-feeding for the child                                 by calling us at 1-800-567-2594 or by email
                                                 and the benefit of KEYTRUDA® therapy                                    at medinfocanada@merck.com.
                                                 for the woman
                                                                                                                                                                        ONCO-1226035-0000

 ALK=anaplastic lymphoma kinase; EGFR=epidermal growth factor receptor; NCCN=National Comprehensive Cancer Network; NSCLC=non-small cell lung carcinoma;
 PD-L1=programmed cell death ligand 1; TPS=tumour proportion score
 References: 1. KEYTRUDA® Product Monograph. Merck Canada Inc. July 20, 2017. 2. National Comprehensive Cancer Network. Clinical Practice Guidelines in Oncology.
 Non-small cell lung cancer. Version 5.2017. March 16, 2017.
 ®
  Merck Sharp & Dohme Corp. Used under license.
 © 2017 Merck Canada Inc. All rights reserved.
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Canadian Journal of

             Volume 10 | issue 3
                                                          pathology
                                                          Official Publication of the Canadian Association of Pathologists

EDitoR-iN-ChiEF                                             table of Contents
                                                           4
George M Yousef MD, PhD, FRCPC

EDitoR EMERitUS                                                Letter from the Editor-in-Chief: Publicly available data: a game
J. Godfrey Heathcote MA, MB, BChir, PhD, FRCPC                 changer in modern research?

                                                           9
FoUNDiNg EDitoR
                                                               Molecular Pathology Corner: Molecular testing in gastrointestinal
Jagdish Butany MBBS, MS, FRCPC
                                                               stromal tumours – we’ve got the GIST of it, now let’s go forward.
aSSoCiatE EDitoR                                               Authors: Caroline S Allen and Catherine J Streutker MD, MSc, FRCPC.

                                                          17
Martin J. Trotter MD, PhD, FRCPC
                                                               Pathologists’ Assistants Corner: Case of the month -
PUbliShiNg EDitoR
Deborah McNamara
                                                               eye melanoma
                                                               Author: Martin Grealish MLT, MTM, PA(CCCPA).
aRt DiRECtoR
                                                               disCussion
                                                          21
Sherri Keenan

traNSlatioN                                                    Uncertain about uncertainty in pathology reports
Jocelyne Demers Owoka
                                                               Author: Jerusha Selvanayagam and Martin Hyrcza MD, PhD.
Éliane Fréchette
Magali Cloutier Provencher
                                                               guidelines
                                                          28
PUbliShiNg agENCy
Clockwork Communications inc.                                  Measuring workload in nephropathology: a Canadian experience.
PO Box 33145, Halifax, NS, B3L 4T6                             Authors: Kevin Yi Mi Ren MD, et al.
902.442.3882 / info@ClockworkCanada.com

                                                               ReseaRCh aRtiCle
                                                          40
Canadian Journal of Pathology is a peer-reviewed
journal published four times per year, by Clockwork
Communications Inc., on behalf of the Canadian                 Clinical impact reporting and assessment of non-conforming
Association of Pathologists.                                   events in anatomical pathology.
                                                               Authors: Lisa M. DiFrancesco MD, FRCPC, Denise LaPerle MLT,
We cannot assume responsibility or commitment for
                                                               Tamara Trotter MLT, Máire A. Duggan MD, FRCPC.
unsolicited material. Any editorial material, including
photographs, that are accepted from an unsolicited
                                                               pathology infoRmatiCs
                                                          51
contributor, will become the property of the
Canadian Association of Pathologists.
                                                               Machine learning in pathology: A primer on techniques and
Copyright Canadian Association of Pathologists                 applications.
(CAP-ACP). All rights reserved. Reprinting in part             Authors: Adrian B. Levine MD, Jasleen K. Grewal BSc, Steven J. M. Jones
or in whole forbidden without express written
                                                               PhD, FRSC, FCAHS, Stephen Yip MD, PhD, FRCPC.
consent from CAP-ACP.

                                                               Case RepoRt & ReViews
                                                          60
       We welcome editorial submissions to
       www.CanadianJournalOf Pathology.ca
                                                               Divergent presentations of pulse granulomas: A sequela of colonic
   Publications Mail Agreement No. 43490512                    injury that is important to recognize
             ISSN 1918-915X (print)                            Authors: Jordan Sim MD, Fawaz Halwani MD, Goo Lee MD, PhD.

                                                          65
            ISSN 1918-9168 (online)
   Return undeliverable Canadian addresses to:
        Clockwork Communications inc                           Case report: Unsuspected giant cell coronary arteritis - a reminder
                 PO Box 33145                                  to clinicians and pathologists to advocate for autopsies.
               Halifax, NS B3L 1K3                             Authors: Guy Fradet MD, FRCSC, Dwayne Wenzel MD, William A.
                                                               Stinson BSc.
          www.cap-acp.org                                         Revue canadienne de pathologie | volume 10, numéro 3 | www.cap-acp.org   3
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LETTER FROM THE
EDITOR-IN-CHIEF

PUBLICLY AVAILABLE DATA:
A GAME CHANGER IN MODERN RESEARCH?

P
      ublicly available databases have been revolutionizing                A recent Canadian initiative – the Tannenbaum Open
      the world of research in recent years. Several examples              Science Institute – transformed the Montreal Neurological
      of highly curated open-access datasets include: The                  Institute into the first fully open science institute in the
Cancer Genome Atlas (TCGA), the International Cancer                       world. Its guiding principles include open access (of data,
Genome Consortium (ICGC), Gene Expression Omnibus                          protocols, and reagents), open research partnerships, open
(GEO), SNP databases, and many others. Databases of this                   21st century bio/data banking, and open intellectual
scale are ordinarily made freely available to the scientific               property. Moreover, publically available data are not
research community. These databases, that are often a result               restricted to scientific results and spans numerous sectors.
of large scale international collaboration, rely on high
quality data and a solid study design. As a result these                   Open access is not limited to research results but can also
databases usually involve a large number of cases obtained                 include analytical tools and programs that can be of great
from multiple institutions across the world and equate to a                help to researchers. Several programs are available for large
multimillion dollar investment.                                            scale genomics and proteomics analysis like Cytoscape, gene
                                                                           MANIA, and many more. Moreover, several of these
Data-sharing can have many advantages in the world of                      analytical tools are directly linked to and integrated with
research and it has the potential to lead us to the precipice              high quality public databases which make it easier for
of a new era in the scientific community. Data sharing                     researchers to navigate through them and to perform simple
provides, for example, a unique and cost-effective                         analysis without the need for IT expert.
opportunity for many individual or small research groups
to utilize data for free. It provides access to high-quality               Caution should, however, be taken when analyzing public
information that can be used for initial screening of research             databases as there are a number of factors that can affect
hypothesis in small labs. Additionally, it can also be utilized            the quality of open access data and analytics. These include
as an independent validation set for experimental results.                 contamination, suboptimal experimental protocols,
There are several examples in recent literature when public                suboptimal statistical analysis, and technical experimental
data sets were used to enhance the quality and credibility of              differences resulting in variation of results.
research findings. 1,2 Another point to consider is that
making data publically available increases transparency and                Moving forward, an important obstacle that needs to be
collaboration within the research community and gives                      overcome is the lack of standardization between platforms
others the opportunity to independently verify the data.                   that use different technologies/experimental protocols that
Data-sharing can also maximize the potential of
interdisciplinary research and open the doors to a holistic
approach in research.                                                                                                  continued on page 6

4   Canadian Journal of Pathology | Volume 10, Issue 3 | www.cap-acp.org
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LETTRE DU RÉDACTEUR
EN CHEF

LES DONNÉES ACCESSIBLES AU PUBLIC :
UN ÉLÉMENT QUI CHANGE LA DONNE DANS LA
RECHERCHE MODERNE?

A
      u cours des dernières années, les bases de données          autres l’occasion de vérifier de manière indépendante les
      accessibles au public ont révolutionné le monde de la       données. Le partage de données peut aussi optimiser le
      recherche. Parmi les nombreux exemples d’ensembles          potentiel de la recherche interdisciplinaire et ouvrir les
de données en libre accès très bien organisés, notons : The       portes à une approche holistique dans le domaine de la
Cancer Genome Atlas (TCGA), the International Cancer              recherche.
Genome Consortium (ICGC), Gene Expression Omnibus
(GEO), les bases de données SNP et plusieurs autres. Les bases    Une initiative canadienne récente — le Tannenbaum Open
de données de cette envergure sont habituellement accessibles     Science Institute — a permis à l’Institut neurologique de
gratuitement pour la communauté de recherche scientifique.        Montréal de devenir le premier institut scientifique au monde
Ces dernières, qui sont souvent le résultat d’une collaboration   dont les données sont entièrement accessibles. Ses principes
internationale de grande envergure, dépendent de données de       directeurs incluent l’accès libre (aux données, protocoles et
grande qualité et d’une solide méthodologie. Par conséquent,      réactifs), les partenariats de recherche ouverts, les banques de
ces bases de données comportent habituellement un grand           données/biologiques du XXIe siècle ouvertes et la propriété
nombre de cas qui ont été obtenus de différents établissements    intellectuelle ouverte. En outre, les données accessibles au
à travers le monde et équivalent à un investissement de           public ne sont pas restreintes aux conclusions scientifiques et
plusieurs millions de dollars.                                    couvrent de nombreux secteurs.

Le partage de données peut présenter de nombreux                  L’accès libre ne se limite pas aux conclusions de recherche,
avantages dans le monde de la recherche en plus d’avoir le        mais peut aussi inclure des outils et des programmes de
potentiel de nous amener au seuil d’une nouvelle ère au sein      recherche qui peuvent s’avérer d’une grande aide pour les
de la communauté scientifique. Le partage des données             chercheurs. De nombreux programmes sont disponibles pour
offre, par exemple, une occasion unique et économique pour        les analyses génomiques et protéomiques de grande envergure,
plusieurs personnes ou de petits groupes de recherche             comme Cytoscape, gene MANIA, et plusieurs autres. De plus,
d’utiliser gratuitement des données. Il permet d’avoir accès      plusieurs de ces outils analytiques sont directement liés et
à de l’information de grande qualité qui peut être utilisée       intégrés à des bases de données publiques de grande qualité
pour l’analyse initiale d’une hypothèse de recherche en petits    permettant ainsi aux chercheurs de les consulter facilement et
laboratoires. De plus, le partage de données peut également       d’effectuer de simples analyses sans avoir recours à un expert
être utilisé comme ensemble de validation indépendante            en TI.
pour les résultats expérimentaux. Il existe dans la littérature
récente plusieurs exemples où les ensembles de données            La prudence est cependant de mise lorsqu’on analyse des
publiques ont été utilisés pour rehausser la qualité et la        bases de données publiques, car un certain nombre de
crédibilité des conclusions de recherche.1,2 Un autre élément     facteurs peuvent influencer la qualité des données en libre
à prendre en considération est que le fait de donner libre        accès et l’analytique. Parmi ces facteurs, notons : la
accès aux données accroît la transparence et la collaboration     contamination, les protocoles expérimentaux sous-
au sein de la communauté de recherche tout en donnant aux         optimaux, les analyses statistiques sous-optimales et les

                                                             Revue canadienne de pathologie | volume 10, numéro 3 | www.cap-acp.org   5
Pathology pathologie - Digital Pathology - Revue canadienne de - Amazon S3
lEttRE DU RéDaCtEUR EN ChEF (suite)

différences expérimentales techniques entraînant une                         technologie qui oblige les chercheurs à développer un plan
variation des résultats.                                                     pour rendre publics les résultats de recherches financées par
                                                                             l’État dans l’année suivant leur publication.
À l’avenir, un obstacle important que l’on doit surmonter est
le manque de normalisation entre les plateformes qui utilisent               L’accès libre aux résultats de recherche constitue une
différentes technologies/protocoles expérimentaux et qui peut                révolution prometteuse et substantielle dans nos normes de
parfois empêcher de comparer les résultats. Néanmoins, les                   recherche. Cette méthode possède des avantages considérables
outils informatiques ainsi que la normalisation de la                        qui l'emportent sur ses limites potentielles. La communauté
présentation des ensembles de données pourraient faire en                    scientifique devrait travailler main dans la main pour orienter
sorte que l’information devienne comparable et échangeable,                  la recherche en pathologie vers une nouvelle ère informatique.
pavant ainsi la voie à une plus grande collaboration et
davantage d’innovations dans le monde de la recherche. Plus                  George M. Yousef, M. D., Ph. D., FRCPC
de transparence et de détails techniques sont nécessaires pour               Rédacteur en chef, Revue canadienne de pathologie
rendre les résultats comparables (type d’échantillons, sous-
types histologiques, procédure exacte pour l’extraction et le
traitement des molécules, etc.) et ils devraient tous être liés aux          Références :
données.
                                                                             1. Butz H., Szabo P.M., Nofech-Mozes R., Rotondo F.,
On devrait encourager et renforcer encore davantage cette                       Kovacs K., Mirham L. et coll., Integrative bioinformatics
attitude collaborative. Les organismes gouvernementaux                          analysis reveals new prognostic biomarkers of clear cell
devraient s’assurer que tout laboratoire de recherche financé                   renal cell carcinoma, Clin chem., 2014;60(10):1314-26.
par l’État rend public son travail. La générosité associée au
partage des données devrait toutefois aussi être reconnue à                  2. Yousef G.M., Polymeris M.E., Yacoub G.M., Scorilas A.,
l’échelle universitaire. Certains pays ont d’ailleurs entrepris                 Soosaipillai A., Popalis C. et coll., Parallel overexpression
des démarches en ce sens. Par exemple, en 2013, les États-                      of seven kallikrein genes in ovarian cancer, Cancer res.,
Unis ont élaboré une politique relative à la science et à la                    2003;63(9):2223-7.

                                                                 lEttER FRoM thE EDitoR-iN-ChiEF (cont.)

can sometimes make the results incomparable. Nonetheless,                    Open access to research results is a promising and substantial
informatics tools, along with standardizing the format of                    revolution to our standards of research. It has significant
data sets, could make information comparable and                             advantages that outweigh its potential limitations. The
exchangeable thus paving the road for further collaboration                  scientific community should work together to bring pathology
and innovation in the world of research. More transparency                   research into a new era of informatics.
and technical details are needed to make results comparable
(sample type, histological subtype, exact procedure used for                 George M. Yousef MD, PhD, FRCPC
molecular extraction and processing, etc.) and should be all                 Editor-in-Chief, Canadian Journal of Pathology
linked to the data.
                                                                             References:
This collaborative attitude should be encouraged and further
enforced. Government agencies should ensure that any                         1. Butz H, Szabo PM, Nofech-Mozes R, Rotondo F, Kovacs
publicly-funded research labs make their work publicly                          K, Mirham L, et al. Integrative bioinformatics analysis
available. The generosity of data-sharing should, however,                      reveals new prognostic biomarkers of clear cell renal cell
also be academically recognized. Some countries have begun                      carcinoma. Clin Chem. 2014;60(10):1314-26.
taking steps in this. As an example, the US established a
Science and Technology policy, in 2013, that requires                        2. Yousef GM, Polymeris ME, Yacoub GM, Scorilas A,
researchers to develop a plan to make the results of federally-                 Soosaipillai A, Popalis C, et al. Parallel overexpression of
funded research publicly available within one year of                           seven kallikrein genes in ovarian cancer. Cancer Res.
publication.                                                                    2003;63(9):2223-7.

6    Canadian Journal of Pathology | Volume 10, Issue 3 | www.cap-acp.org
Pathology pathologie - Digital Pathology - Revue canadienne de - Amazon S3
Striving to
outsmart cancer.
Together.

AbbVie and pathologists
are collaborating on
common objectives:
discovering and
developing medicines that
drive transformational
improvements in
cancer treatment.

abbvieoncology.com
@abbviecanada
Pathology pathologie - Digital Pathology - Revue canadienne de - Amazon S3
EDitoRial boaRD
      EDitoRial boaRD   Irvaym B. Barsoum MD, MSc, PhD; Michael Carter MD, PhD; Hala Faragalla MD, FRCPC; Louis Gaboury
                        M.D., Ph.D., F.R.C.P.(C), F.C.A.P.; John Gartner MD CM, FRCPC; Laurette Geldenhuys MBBCH, FFPATH,
                        MMed, FRCPC, MAEd, FIAC; Zeina Ghorab MD, MSc; Nadia Ismiil MBChB, FRCPC; Jason Karamchandani
                        MD; Adriana Krizova MD, MSc, FRCPC; David Munoz MD, MSc, FRCPC; Christopher Naugler MD, FRCPC;
                        Tony Ng MD, PhD FRCPC; Sharon Nofech-Mozes MD; Maria Pasic PhD, FCACB; Aaron Pollett MD, MSc,
                        FRCPC; Rola Saleeb MD; Harman Sekhon MD, PhD, FCAP; Monalisa Sur MBBS, FCPath, MMed., MRCPath,
                        FRCPC; Aducio Thiesen MD, PhD, MSc, FRCPC; Stephen Yip MD, PhD, FRCPC.

                        iNtERNatioNal EDitoRial boaRD
                        Emma H. Allott PhD, University of North Carolina, USA; Fredrik Bosman MD, PhD, University of Lausanne,
                        Switzerland; Daniel Chan PhD, DABCC, FACB, Johns Hopkins University School of Medicine, USA; Runjan
                        Chetty MB BCh, FRCPA, FFPath, FRCPath, FRCPC, FCAP, Dphil, University of Toronto, Canada; Kumarasen
                        Cooper MBChB, Dphil, FRC path, University of Pennsylvania, USA; Brett Delahunt BSc Hons BMedSc MB
                        ChB MD FRCPA FFSc FRCPath, University of Otago, New Zealand; Sunil R Lakhani BSc (Hon), MBBS,
                        MRCPath, MD, FRCPath, FRCPA, The University of Queensland, Australia; Virginia A. LiVolsi MD, MASCP,
                        University of Pennsylvania, USA; Ricardo Lloyd MD, PhD, University of Wisconsin, USA; Jesse Mckenney MD,
                        Cleveland Clinic, USA; Chris Meijer MD, PhD, VU University, The Netherlands; George Netto MD, PhD, Johns
                        Hopkins University School of Medicine, USA; Isobel Scarisbrick PhD, Mayo Clinic, USA; Manfred Schmitt Dr.
                        rer. nat., Dr. med. habil. (Ph. D., M.D. sci.), Dipl.-Biologist, Technical University, Munich, Germany; Iris Schrijver
                        MD, Stanford University, USA; Andreas Scorilas PhD, University of Athens, Greece; Ming Tsao FRCPC, MD,
                        University of Toronto, Canada; Mark Wick MD, University of Virginia, USA.

    CoMité DE RéDaCtioN

                                                                                                                                           CoMité DE RéDaCtioN
    Irvaym B. Barsoum, M.D., M. Sc, Ph.D; Michael Carter, M.D., Ph. D; Hala Faragalla, M.D., FRCPC; Louis
    Gaboury, M.D., Ph. D., FRCPC, FCAP; John Gartner, M.D. CM, FRCPC; Laurette Geldenhuys, MBBCH,
    FFPATH, MMed, FRCPC, MAEd, FIAC; Zeina Ghorab, M.D.; Nadia Ismiil, MBChB, FRCPC; Jason
    Karamchandani, M.D.; Adriana Krizova, M.D., M. Sc, FRCPC; David Munoz, M.D., M. Sc, FRCPC;
    Christopher Naugler, M.D., FRCPC; Tony Ng, M.D., Ph. D., FRCPC; Sharon Nofech-Mozes, M.D.; Maria
    Pasic, Ph. D., FCACB; Aaron Pollett, M.D., M. Sc, FRCPC; Rola Saleeb M.D.; Harman Sekhon, M.D., Ph.
    D, FCAP; Monalisa Sur, MBBS, FCPath, MMed., MRCPath, FRCPC; Aducio Thiesen, M.D., Ph. D, M. Sc,
    FRCPC; Stephen Yip, M.D., Ph. D, FRCPC.

    CoMité DE RéDaCtioN iNtERNatioNal
    Emma H. Allott, Ph. D, Université de North Carolina, É.-U.; Fredrik Bosman, M.D., Ph. D., Université de
    Lausanne, Suisse; Daniel Chan, Ph. D., DABCC, FACB, faculté de médecine de l’Université Johns Hopkins,
    É.-U.; Runjan Chetty, MB BCh, FRCPA, FFPath, FRCPath, FRCPC, FCAP, Dphil, Université de Toronto,
    Canada; Kumarasen Cooper ,MBChB, Dphil, FRC path, Université de la Pennsylvania, É.-U.; Brett Delahunt,
    B. Sc Hons BMedSc MB ChB MD FRCPA FFSc FRCPath, Université d’Otago, Nouvelle-Zélande; Sunil R
    Lakhani, B. Sc (Hon), MBBS, MRCPath, M.D., FRCPath, FRCPA, Université de Queensland, Australie;
    Virginia A. LiVolsi, M.D., MASCP, Université de la Pennsylvanie, É.-U.; Ricardo Lloyd, M.D., Ph. D,
    Université du Wisconsin, É.-U.; Jesse Mckenney, M.D., Clinique de Cleveland, É.-U.; Chris Meijer, M.D.,
    Ph. D., Université VU, Pays-Bas; George Netto, M.D., Ph. D., faculté de médecine de l’Université Johns
    Hopkins, É.-U.; Isobel Scarisbrick, Ph. D., Clinique Mayo, É.-U.; Manfred Schmitt, Dr. rer. nat., Dr. med.
    habil. (Ph. D., M.D. sci.), Dipl.-Biologist, Université polytechnique, Munich, Allemagne; Iris Schrijver, M.D.,
    Université Stanford, É.-U.; Andreas Scorilas, Ph. D., Université d’Athènes, Grèce; Ming Tsao, FRCPC, M.D.,
    Université de Toronto, Canada; Mark Wick, M.D., Université de la Virginie, É.-U.

8    Canadian Journal of Pathology | Volume 10, Issue 3 | www.cap-acp.org
Pathology pathologie - Digital Pathology - Revue canadienne de - Amazon S3
moleCulaR pathology CoRneR
                                                                                                                 This article was peer-reviewed.

                                                             KeywoRds:
                                                   gist, molecular: cKit, pdgfRa.

MolECUlaR tEStiNg iN
gaStRoiNtEStiNal StRoMal tUMoURS –
WE’vE got thE giSt oF it, NoW lEt’S go
FoRWaRD
authors:         Caroline S Allen1 and Catherine J Streutker2 MD, MSc, FRCPC.

                1
affiliations:      Faculty of Arts and Science, Queen’s University, Kingston, ON, Canada.
                2
                 Department of Laboratory Medicine, St. Michael’s Hospital and the University of Toronto, Toronto,
                 ON, Canada.

                           The authors declare that there are no conflicts of interest regarding the publication of this paper.

 All authors have provided CAP-ACP with non-exclusive rights to publish and otherwise deal with or make use of this
                   article, and any photographs/images contained in it, in Canada and all other countries of the world.

                                                 ABSTRACT

                                                 Molecular testing in gastrointestinal stromal tumours has expanded beyond the
                                                 original discovery of cKIT mutations. Molecular analysis is essential for diagnosis,
                                                 prognostication and treatment of these tumours.

Review                                           recognized that these tumours are a             cell membrane (exon 11, most common),
                                                 specific entity, likely arising from the        just outside the membrane in the
In the days prior to effective                   interstitial cells of Cajal (reviewed in 3).    extracellular ligand binding domain (exon
immunohistochemistry and molecular               Shortly afterward, the tyrosine kinase          9, second most common, and exon 8,
testing (i.e. the late 1990s and early 2000s),   inhibitor imatinib (STI571, Gleevec,            very rare) and in the kinase enzymatic site
gastrointestinal stromal tumours (GISTs)         Glivec, Novartis Pharmaceuticals Corp)          (exons 13, 17, less commonly).6 It was
were given a wide variety of names – GIST,       was proposed as a treatment which               also recognized that, while the majority of
gastrointestinal autonomic nerve tumour          subsequently showed considerable effect in      GISTs (80-90%) contained cKIT
(GANT), leiomyoma/leiomyosarcoma,                trials.4                                        mutations, a proportion (‘wild-type’
etc. These tumours were difficult to                                                             GIST) did not. Clearly, cKIT was not the
diagnose, unpredictable in behaviour and         Early studies on molecular testing              only gene involved. A gene coding for
resistant       to      chemotherapy      and    focussed on diagnosis as well as the            another TK protein, platelet-derived
radiotherapy, leaving surgery as the only        relationship of cKIT mutations to               growth factor-alpha (PDGFRA) was
useful treatment option. With the                survival, basically attempting to predict       noted to be mutated in 5-7% of GIST
recognition of gain-of-function mutations        malignant behaviour.5 It was found that         cases. Activating PDGFRA mutations
in the tyrosine kinase (TK) gene cKIT in a       the mutations tend to cluster into specific     tend to be focussed in the tyrosine kinase
majority of these tumours1 and the advent        areas     of    the     gene:    in    the      (TK) activity areas (exon 18, exon 14) as
of the CD117/c-kit antibody for                  regulatory/autoinhibitory area in the           well as in the juxtamembrane (exon 12)
immunohistochemistry in 1998,2 we                juxtamembranous zones just inside the           and rarely in the proximal extracellular

                                                                   Revue canadienne de pathologie | volume 10, numéro 3 | www.cap-acp.org   9
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moleCulaR pathology CoRneR

  MolECUlaR tEStiNg (cont.)

  cáÖìêÉ=NK=
                                                                                                       Which mutation is present also matters
                                                                                                       with respect to prediction of response to
                                                                                                       tyrosine kinase inhibitors (TKI) such as
                                                                                                       imatinib and related medications such as
                                                                                                       sunatinib. cKIT mutations in exon 11, 13
                                                                                                       and 17 were shown to have a high
                                                                                                       response rate (80-100%) while exon 9
                                                                                                       mutations showed a response rate
                                                                                                       approaching 50%.7 Some exon 11
                                                                                                       mutations (particularly L576P) show lesser
                                                                                                       response to imatinib.13 The PDGFRA-
                                                                                                       mutated tumours are generally responsive
                                                                                                       to imatinib, though the D842V mutation
                                                                                                       in exon 18 is more often unresponsive.14,15
                                                                                                       In tumours with mutations considered to
                                                                                                       be ‘resistant’, response can still be obtained
                                                                                                       with higher doses of targeted therapy, i.e.
                                                                                                       cKIT exon 9 mutations (Figure 1).16
  Most common primary cKIT and PDGFRA mutations. *: Decreased response to tyrosine kinase inhibitors
  (TKI). **: Often lacks response to TKI. ***: May respond to TKI but requires increased dose.14,15
                                                                                                       While it was originally thought that each
                                                                                                       GIST contained only one characteristic
  zones (exon 10) (Figure 1). The presence           SDHC and SDHD. Silencing by promoter              TK mutation, treatment with imatinib
  of the cKIT and PDGFRA mutations tend              methylation appears relatively common.10          brought evidence of the development of
  to be mutually exclusive.7                                                                           resistance to treatment. Sequencing of
                                                     Further investigation of the remaining            these metastatic lesions demonstrated
  Studies continued to demonstrate a                 “wild-type” cases where the cKIT,                 secondary cKIT mutations, particularly in
  proportion of cases that were wild-type            PDGFRA and SDH genes are all normal               exon 17, exon 13 and exon 14.11
  for both cKIT and PDGFRA. One subset               has discovered rare causal mutations in
  of these, particularly those involved in the       NF1, BRAF, NRAS and PIK3CA genes,                 Currently, molecular testing of all GISTs is
  Carney triad/Carney-Stratakis syndromes            leaving relatively few cases as true “wild        suggested at diagnosis, though surgery
  (gastric        GIST,         extra-adrenal        type” GISTs.11                                    remains the primary modality of treatment.
  paraganglioma          and      pulmonary                                                            This allows for diagnosis as well as
  chondroma/GIST plus paraganglioma),                The specific mutations, to a considerable         immediate molecular testing. Neo-adjuvant
  were discovered to harbour abnormalities           extent,      predict     clinicopathologic        therapy to shrink large gastric tumours
  in the succinate dehydrogenase (SDH)               behaviours. cKIT exon 9 mutation GISTs            prior to definitive surgery can minimize the
  gene.8 SDH is involved in the respiratory          are generally noted to be aggressive small        loss of gastric tissue, allowing a wedge
  complex, and has 4 subunits (SDHA,                 bowel tumours.12 cKIT exon 11 deletions           resection rather than a gastrectomy.
  SDHB, SDHC and SDHD). In contrast to               lead to aggressive, high risk gastric             Adjuvant therapy is used for patients with
  the gain-of-function mutations of cKIT             tumours while exon 11 single nucleotide           high-risk GISTs to reduce the risk of
  and PDGFRA, SDH-associated GIST                    substitutions are generally small, lower          metastasis. Here the molecular testing is not
  demonstrate silencing or loss of the gene,         risk tumours. cKIT exon 13 mutations are          only relevant to predict response and
  either by mutations or promoter                    higher risk when in the stomach. Overall,         therefore dose of imatinib or related drug;
  methylation – damage to any of the                 PDGFRA-associated tumours, almost                 the mutation with attendant risk of
  subunits causing loss of the entire                always gastric cases, tend to have indolent       progression is part of the decision making
  complex.         Therefore,       immuno-          behaviour and generally do not require            on high-risk features, driving the use of
  histochemistry for SDHB where there is             adjuvant therapy. The SDH-related                 adjuvant therapy. Patients who progress
  total/near complete loss of the normal             subgroup of GISTs tends to occur in the           while on therapy may need repeat biopsy
  strong granular cytoplasmic staining               stomach in younger patients and has a             of the metastatic lesion to determine if there
  (mitochondrial       staining)    can     be       particular gross appearance of multi-             is a treatable secondary mutation present.
  diagnostic; immunohistochemistry for               nodular infiltrating masses in the gastric
  SDHA is also available.9 Mutations are             wall, sometimes separated by fibrous              While surgery remains a mainstay,
  most commonly found in SDHA                        septae. While even small SDH-associated           endoscopic needle core biopsies (EUS-FNB)
  (approximately           28%),         with        GISTs may metastasize, they are still             or tunnel or sink (single incision needle
  approximately 20% each in SDHB,                    relatively indolent.9                             knife) endoscopic biopsies are increasingly

  10    Canadian Journal of Pathology | Volume 10, Issue 3 | www.cap-acp.org
moleCulaR pathology CoRneR

                                                                                         MolECUlaR tEStiNg (cont.)

being used to obtain tissue from                     Cajal in health and disease. Part II:      10. Miettinen M, Lasota J. Succinate
submucosal/muscularis propria lesions.               ICC and gastrointestinal stromal               dehydrogenase deficient
Molecular testing for GIST cases has been            tumours. Histopathology.                       gastrointestinal stromal tumours – a
predominantly performed by Sanger                    2007;50(2):190-202.                            review. Int J Biochem Cell Biol.
sequencing and pyrosequencing for                                                                   2014;53:514-519.
hotspots. However, next generation                4. Tuveson DA, Willis NA, Jacks T,
sequencing (NGS) is becoming more widely             Griffin JD, Singer S, Fletcher CD, et      11. Szucs Z, Jones RL. Perspectives on
available, with kits covering panels of all the      al. STI571 inactivation of the                 the evolving state of the art
major involved genes. Sequencing can be              gastrointestinal stromal tumor c-KIT           management of gastrointestinal
done on these relatively small biopsy                oncoprotein: biological and clinical           stromal tumours. Transl Gastro and
specimens as long as there is reasonable             implications. Oncogene.                        Hepatol. 2018;3:21-32.
sampling of viable tumour, similar to issues         2001;20(36):5054-8.
in lung adenocarcinomas and colon cancer.17                                                     12. Antonescu CR, Besmer P, Guo T,
                                                  5. Singer S, Rubin BP, Lux, ML, Chen              Arkun K, Hom G, Koryotowski B, et
Since many of the genes involved in the              CJ, Demetri GD, Fletcher CDM, et               al. Acquired resistance to imatinib in
development of GISTs can occur as                    al. Prognostic value of KIT mutation           gastrointestinal stromal tumour
germline mutations associated with other             type, mitotic activity and histologic          occurs through secondary gene
tumours/findings, the possibility of                 subtype in gastrointestinal stromal            mutation. Clin Cancer Res.
underlying familial syndromes (i.e. Carney           tumors. J Clin Oncol. 2002;                    2005;11(11):4182-90.
triad, cKIT germline mutations) should be            20(18):3898-905.
kept in mind.                                                                                   13. Noujaim J, Gonzalez D, Thway K,
                                                  6. Huss S, Kunstlinger H, Wardelmann              Jones RL, Judson I. p.(L567P)-KIT
Overall, the progress made over the past             E, Kleine MA, Binot E, Merkelback-             mutation in GIST: Favorable
20 years in the pathologic and molecular             Bruse S, et al. A subset of                    prognosis and sensitive fo imatinib?
diagnosis of GISTs is a remarkable success           gastrointestinal stromal tumours               Cancer Biol Ther. 2016;17(5):
story. Molecular analysis contributes to             previously regarded as wild-type               543-5.
diagnosis and has both predictive and                tumors carries somatic activating
prognostic implications for treatment and            mutations in KIT exon 8                    14. von Mehren M, Joensuu H.
outcomes, with new options for adjuvant              (p.D419des). Mod Pathol.                       Gastrointestinal stromal tumours. J
and neo-adjuvant therapy. Pathologists               2013;16:1004-1012.                             Clin Oncol. 2018:36(2):136-143.
continue to contribute to the diagnosis
and appropriate treatment of these cases,         7. Heinrich MC, Corless CL, Demetri           15. Lasota J, Miettinen M. Clinical
in conjunction with gastroenterologists,             GD, Blanke CD, von Mehren M,                   significance of oncogenic KIT and
surgeons and medical oncologists.                    Joensuu H, et al. Kinase mutations             PDGFRA mutations in
                                                     and imatinib response in patients              gastrointestinal stromal tumours.
References:                                          with metastatic gastrointestinal               Histopathology. 2008;53:245-266.
                                                     stromal tumour. J Clin Oncol.
1. Nakahara M, Isozaki K, Hirota S,                  2003;21(23):4342-9.                        16. Heinrich MC, Owzar K, Corless CL,
   Miyagawa J, Hase-Sawada N,                                                                       Hollis D, Borden EC, Fletcher CD,
   Taniguchi M, et al. A novel gain of            8. Miettinen M, Wang ZF, Sarlomo-                 et al. Correlation of kinase genotype
   function mutation of c-kit gene in                Rikala M, Osuch C, Rutkowski P,                and clinical outcome in the North
   gastrointestinal stromal tumours.                 Lasota J. Succinate dehydrogenase-             American Intergroup Phase III trial
   Gastroenterology.                                 deficient GISTs: a clinicopathologic,          of imatinib mesylate for treatment of
   1998;115(5):1090-5.                               immunohistochemical, and molecular             advanced gastrointestinal stromal
                                                     genetic study of 66 gastric GISTs              tumour. J Clin Oncol.
2. Sarlomo-Rikala M, Kovatoch AJ,                    with predilection to young age. Am             2008;26(33):5360-7.
   Barusevicius A, Miettinen M.                      J Surg Pathol. 2011;35(11):1712-21.
   CD117: a sensitive marker for                                                                17. Zheng G, Tsai H, Tseng LH, Illei P,
   gastrointestinal stromal tumours               9. Janeway KA, Kim SY, Lodish M,                  Gocke CD, Eshleman JR, et al. Test
   that is more specific than CD34,                  Nose V, Rustin P, Gaal J, et al.               feasibility of next-generation
   Mod Pathol. 1998;11(8);728-34.                    Defects in succinate dehydrogenase             sequencing assays in clinical
                                                     in gastrointestinal tumours lacking            mutation detection of small biopsy
3. Streutker CJ, Huizinga JD, Driman                 KIT and PDGFRA mutations. Proc                 and fine needle aspiration specimens.
   DK, Riddell RH. Interstitial cells of             Natl Acad Sci USA. 2011;108:314-318.           AJCP. 2016;145:696-702.

                                                                   Revue canadienne de pathologie | volume 10, numéro 3 | www.cap-acp.org   11
RubRiQue de pathologie molÉCulaiRe
                                                                                                           Cet article a été révisé par des pairs.

                                                                  mots-ClÉs :
                                                       tsgi, moléculaire, c-kit, pdgfRa

  tEStS MoléCUlaiRES Et tUMEURS
  StRoMalES gaStRo-iNtEStiNalES : lE
  tEMPS ESt vENU DE PaSSER à la
  PRoChaiNE étaPE
  auteurs :         Caroline S. Allen1 et Catherine J. Streutker, M.D., M. Sc., FRCPC2.

  affiliations : 1Faculté des arts et des sciences, Université Queen’s, Kingston, Ontario, Canada
               2
                 Département de médecine de laboratoire, Hôpital St. Michael et Université de Toronto, Toronto,
                 Ontario, Canada

                                                                   La version originale du présent manuscrit a été soumise en anglais,
                                                                     puis traduite en français par Éliane Fréchette, traductrice agréée.

                                    Les auteurs ne déclarent aucun conflit d’intérêts relativement à la publication de cet article.

       De plus, ils ont tous accordé à la CAP-ACP le droit non exclusif de publier et d’utiliser cet article, et toute image ou
                     photographie qu’il renferme, ou d’en disposer autrement, au Canada et partout ailleurs dans le monde.

                                                     RÉSUMÉ

                                                     Les tests moléculaires réalisés en cas de tumeurs stromales gastro-intestinales
                                                     servent désormais à bien plus que la simple mise en évidence de mutations de c-kit.
                                                     En effet, les analyses moléculaires sont maintenant essentielles au diagnostic, au
                                                     pronostic et au traitement de ces tumeurs.

                                                    Article                                      radiothérapie, étaient difficiles à
                                                                                                 diagnostiquer et leur comportement était
                                                    Avant       l’arrivée     des    analyses    imprévisible. L’intervention chirurgicale
                                                    immunohistochimiques et moléculaires         était alors considérée comme la seule
                                                    efficaces (vers la fin des années 1990 et    option de traitement utile. À la suite de
                                                    le début des années 2000), divers noms       la découverte de mutations de gain de
                                                    ont été donnés aux tumeurs stromales         fonction dans le gène de la tyrosine
                                                    gastro-intestinales (TSGI) : TSGI,           kinase c-kit dans la majorité de ces
                                                    tumeurs du système nerveux autonome          tumeurs1, et de l’avènement de
                                                    du tube digestif (GANT), léiomyomes,         l’anticorps CD117 (c-kit) à des fins
                                                    léiomyosarcomes, etc. Ces tumeurs,           d’immunohistochimie en 19982, on a
                                                    résistantes à la chimiothérapie et à la      reconnu les TSGI comme des entités

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propres,            qui        prenaient        mettre en relief une proportion de cas de
vraisemblablement naissance dans les            « type sauvage » tant pour c-kit que
cellules interstitielles de Cajal (voir         pour PDGFRA. On a découvert que l’un
référence no 3). Peu de temps après,            des sous-ensembles de ces mutations,
l’imatinib, un inhibiteur de la tyrosine        particulièrement celles associées à la
kinase (STI-571, Gleevec®, Glivec®,             triade de Carney et au syndrome de
Novartis Pharmaceuticals Corp.) a été           Carney-Stratakis (TSGI, paragangliome
proposé pour traiter les TSGI. Des              extrasurrénalien       et     chondrome
répercussions considérables ont été             pulmonaire ou TSGI accompagnée d’un
observées lors des essais cliniques             paragangliome), entraîne des anomalies
réalisés à cet effet4.                          du gène succinate déshydrogénase
                                                (SDH)8. Le SDH, qui présente quatre
Les premières études portant sur les tests      sous-unités (SDHA, SDHB, SDHC et
moléculaires étaient axées sur le               SDHD) joue un rôle dans le complexe
diagnostic et la relation entre les             respiratoire.     Contrairement      aux
mutations de c-kit et les chances de            mutations de gain de fonction de c-kit et
survie, et tentaient essentiellement de         de PDGFRA, les TSGI associées à SDH
prédire la malignité des tumeurs5. On a         démontrent un silençage ou une perte
constaté que les mutations avaient              d’expression génique, attribuable soit à
tendance à toucher des régions précises         des mutations ou à la méthylation du
du gène : la région régulatrice/                promoteur. Les dommages occasionnés
autoinhibitrice           des         zones     à l’une ou l’autre des sous-unités
juxtamembranaires situées à l’intérieur         entraînent la perte du complexe en
de la membrane cellulaire (exon 11,             entier.     Par      conséquent,     une
région la plus courante); la région située      immunohistochimie pour SDHB qui
tout juste en dehors de la membrane,            présente une absence totale ou quasi
dans le domaine extracellulaire de              totale de coloration cytoplasmique
liaison au ligand (exon 9, deuxième             granulaire (coloration mitochondriale)
région la plus courante, et exon 8, très        normalement       intense     peut   être
rare); et dans le site enzymatique              diagnostique. Une immunohistochimie
tyrosine kinase (exons 13 et 17, région         peut aussi être réalisée pour SDHA9. On
moins courante)6. On a également                observe des mutations dans environ 28
conclu que, bien que la majorité (80 à 90       % des SDHA et dans près de 20 % des
%) des TSGI présentaient des mutations          SDHB, SDHC et SDHD. Le silençage dû
de c-kit, ce n’était pas le cas de toutes les   à la méthylation du promoteur semble
tumeurs (TSGI de « type sauvage »). C-          être assez courant10.
kit n’était donc manifestement pas le
seul gène en cause. On a alors observé          D’autres études des cas restants de « type
qu’un gène codant pour une autre                sauvage », où les gènes c-kit, PDGFRA
protéine tyrosine kinase, le facteur de         et SDH sont tous normaux, ont permis
croissance dérivé des plaquettes alpha          de révéler des mutations causales rares
(PDGFRA), avait subi des mutations              dans les gènes NF1, BRAF, NRAS et
dans 5 à 7 % des cas de TSGI.                   PIK3CA. Le nombre de cas véritables de
L’activation des mutations de PDGFRA            TSGI de « type sauvage » est donc plutôt
survient principalement dans les zones          restreint11.
d’activité de la tyrosine kinase (exon 18,
exon 14) de même que dans la région             Les mutations permettent, dans une
juxtamembranaire (exon 12) et, plus             large    mesure,     de    prédire    les
rarement, dans les zones extracellulaires       comportements clinicopathologiques.
proximales (exon 10) (figure 1). Les            Par exemple, les TSGI qui présentent une
mutations de c-kit et de PDGFRA sont            mutation de l’exon 9 du gène c-kit
généralement mutuellement exclusives7.          correspondent généralement à des
                                                tumeurs agressives de l’intestin grêle12.
Les études continuent cependant de              Les délétions de l’exon 11 de c-kit sont

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  cáÖìêÉ=NK=
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                                                                                                                        réponse élevé (80 à 100 %), alors que
                                                                                                                        celles subies par l’exon 9 démontrent un
                                                                                                                        taux de réponse de près de 50 %7.
                          Exon 8 : 1 %
                                                  Domaine extracellulaire
                                                                                                                        Certaines mutations de l’exon 11
                          Exon 9 : 10 %
                          AY502-503***                                                                                  (particulièrement la mutation L576P)
                                                                                                  Membrane cellulaire
                                                                                                                        sont associées à un taux de réponse à
                          Exon 11 : 67,5 %
                                                                                                                        l’imatinib moins élevé13. Les tumeurs
                                                Domaine juxtamembranaire
                          V559D, L576P*
                                                                                Exon 12 : 1 %
                                                                                                                        attribuables à des mutations de
                          Exon 13 : 1 %
                                                Domaine tyrosine kinase (TK1)
                                                                                VD61D                                   PDGFRA répondent généralement bien
                          K642E
                                                                                Exon 14 : 0,3 %
                                                                                N569K
                                                                                                                        à l’imatinib, bien que la mutation
                                                Domaine d’insertion kinase
                                                                                                                        D842V de l’exon 18 n’y réponde
                                                                                                                        souvent pas efficacement14,15. Chez les
                          Exon 17 : 0,5 %
                          N822H, N822K,
                                                                                                                        patients où les tumeurs ayant subi des
                                               Domaine tyrosine kinase (TK2)
                          D820Y                                                 Exon 18 : 6,3 %
                                                                                D842V**, D843Y
                                                                                                                        mutations sont considérées comme «
                                                                                                                        résistantes » (par exemple, les mutations
                                                                                                                        de l’exon 9 de c-kit), une réponse peut
                                                                                                                        être obtenue à l’aide de plus fortes doses
  Mutations primaires les plus courantes de c-kit et de PDGFRA * : Diminution de la réponse aux
  inhibiteurs de la tyrosine kinase ** : Réponse irrégulière aux inhibiteurs de la tyrosine kinase
                                                                                                                        du traitement ciblé (figure 1)16.
  *** : Réponse aux inhibiteurs de la tyrosine kinase si dose accrue14,15
                                                                                                                        Si les chercheurs croyaient à l’origine
                                                                                                                        que chaque TSGI contenait une seule
                                                                 quant à elles associées à des tumeurs                  mutation caractéristique de la tyrosine
                                                                 gastriques agressives qui comportent un                kinase, l’imatinib a mis en évidence le
                                                                 niveau de risque élevé, tandis que les                 développement d’une résistance au
                                                                 substitutions mononucléotidiques de                    traitement. Le séquençage de ces lésions
                                                                 l’exon 11 sont habituellement liées à des              métastatiques a révélé la présence de
                                                                 tumeurs de petite taille qui présentent un             mutations secondaires de c-kit,
                                                                 plus faible risque. Les mutations de                   particulièrement dans les exons 17, 13
                                                                 l’exon 13 de c-kit représentent un risque              et 1411.
                                                                 plus élevé quand elles se trouvent dans
                                                                 l’estomac. De façon générale, les                      À l’heure actuelle, l’analyse moléculaire
                                                                 tumeurs associées à PDGFRA, des cas                    de l’ensemble des TSGI est suggérée au
                                                                 qui sont presque toujours gastriques, ont              moment du diagnostic, bien que
                                                                 tendance à adopter un comportement                     l’intervention chirurgicale demeure la
                                                                 indolent et ne nécessitent généralement                principale méthode de traitement.
                                                                 pas de traitement adjuvant. Le sous-                   L’opération permet le diagnostic et la
                                                                 groupe de TSGI associées à SDH a                       réalisation      immédiate      de     tests
                                                                 tendance à survenir dans l’estomac des                 moléculaires. La mise en place d’un
                                                                 patients moins âgés et se présente                     traitement néoadjuvant visant à réduire
                                                                 macroscopiquement sous forme de                        la taille des tumeurs gastriques avant
                                                                 masses multinodulaires infiltrantes                    l’intervention chirurgicale définitive peut
                                                                 situées dans la paroi gastrique, parfois               minimiser la perte de tissu gastrique,
                                                                 séparées par des cloisons fibreuses. Bien              permettant la réalisation d’une résection
                                                                 que même les TSGI de petite taille                     cunéiforme au lieu d’une gastrectomie.
                                                                 associées à SDH puissent métastaser,                   Un traitement adjuvant est proposé aux
                                                                 elles demeurent relativement indolentes9.              patients qui présentent des TSGI
                                                                                                                        associées à un niveau de risque élevé afin
                                                                 Le type de mutation présente influe                    de diminuer le risque de métastase. Dans
                                                                 également sur la prévision de la réponse               de tels cas, les tests moléculaires ne sont
                                                                 aux inhibiteurs de la tyrosine kinase                  pas seulement utiles pour prédire la
                                                                 comme l’imatinib et les médicaments                    réponse au traitement et déterminer la
                                                                 connexes, dont le sunatinib. Les                       dose d’imatinib ou du médicament
                                                                 mutations dans les exons 11, 13 et 17 de               prescrit à administrer. En effet, la

  14    Canadian Journal of Pathology | Volume 10, Issue 3 | www.cap-acp.org
RubRiQue de pathologie molÉCulaiRe

                                                                                   tEStS MoléCUlaiRES (suite)

mutation, et le risque afférent de          TSGI sont le séquençage Sanger et le           de lignée germinale de c-kit) devrait être
progression, font partie des composantes    pyroséquençage, qui permet la mise en          prise en considération.
à risque élevé du processus de prise de     évidence des hotspots mutationnels. Or,
décisions qui encouragent le recours au     le séquençage de nouvelle génération           Globalement, les progrès réalisés au
traitement adjuvant. Les patients dont la   devient de plus en plus accessible; les        cours des 20 dernières années en lien
maladie progresse en cours de traitement    trousses offertes couvrent désormais           avec le diagnostic pathologique et
peuvent devoir subir une autre biopsie de   l’ensemble des principaux gènes en             moléculaire des TSGI sont un
la lésion métastatique pour déterminer si   cause. Le séquençage peut être réalisé sur     remarquable exemple de réussite. Les
une mutation secondaire traitable est       des échantillons de biopsie relativement       analyses moléculaires contribuent au
présente.                                   petits, tant et aussi longtemps que la         diagnostic et ont des répercussions
                                            taille des échantillons de tumeurs viables     prédictives et pronostiques sur le
Bien que l’intervention chirurgicale        est raisonnable, comme c’est le cas pour       traitement et les résultats, proposant de
demeure la principale marche à suivre,      les adénocarcinomes des poumons et le          nouvelles options de traitement adjuvant
les biopsies endoscopiques au trocart       cancer du côlon17.                             et néoadjuvant. Enfin, les pathologistes,
(EUS-FNB) et celles avec incision unique                                                   de concert avec les gastroentérologues,
par aiguille bistouri (single incision      Comme bon nombre des gènes qui                 les chirurgiens et les oncologues,
needle-knife ou SINK) sont de plus en       participent au développement des TSGI          continuent de contribuer au diagnostic
plus utilisées pour prélever des tissus à   peuvent se présenter sous forme de             et au traitement adéquat de ces cas.
partir de lésions de la sous-muqueuse ou    mutations de lignée germinale associées
de la couche longitudinale. Les deux        à d’autres tumeurs, la possibilité de          Pour consulter les références, reportez-
principales      méthodes      d’analyse    syndromes familiaux sous-jacents (par          vous à la page 11.
moléculaire employées dans les cas de       exemple, triade de Carney ou mutations

                                All peer-reviewed articles appearing in this publication have undergone a double blind
                                peer-review process. The views or opinions expressed in this Journal are those of the
                                authors and contributors, and do not necessarily reflect those of this Journal, the editors,
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                                Pathologists (CAP-ACP).

                                Although the CAP-ACP has made reasonable efforts to ensure accuracy the articles
                                herein, the Journal, the editors, the editorial board, the publisher of this Journal, or the
                                CAP-ACP, take no responsibility whatsoever for any errors, omissions, or any
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                                                              Revue canadienne de pathologie | volume 10, numéro 3 | www.cap-acp.org   15
JOIN US FOR THE OAP’S
80TH ANNIVERSARY
September 28-29
ONTARIO ASSOCIATION OF PATHOLOGIST 2018 ANNUAL MEETING
                                                                                  SAVE THE
The OAP is the oldest pathology organization in the country and has been
holding Annual General Meetings since 1937. As a not-for-profit medical society
                                                                                     DATE
organized for educational and scientific purposes, the purpose of the meeting
is to foster excellence in the practice of pathology and laboratory medicine in
Ontario.
Conference Venue: Quartier Tremblant – Base Camp,
1000 Chemin des Voyageurs, Tremblant, Québec J8E 1T1
Accommodations: LeWestin Resort & Spa, Tremblant, Quebec
ROYAL COLLEGE ACCREDITATION
This conference is an Accredited Group Learning Activity (Section 1) as defined
by the Maintenance of Certification program of the Royal College of Physicians
and Surgeons of Canada. This activity was approved by the Canadian Association
of Pathologists.
Through an agreement between the Royal College of Physicians
and Surgeons of Canada and the American Medical Association,
physicians may convert Royal College MOC credits to AMA PRA
Category 1 Credits™. Information on the process to convert Royal
College MOC credit to AMA credit can be found at:
www.ama-assn.org/go/internationalcme.

               TO REGISTER:
https://ontariopathologists.org/2018-annual-meeting/
pathologists’ assistants CoRneR

                                                                  Key woRds:
                                                 Choroidal, melanoma, sclera, ciliary body

CaSE oF thE MoNth
EyE MElaNoMa
authors:             Martin Grealish1, MLT, MTM, PA(CCCAP).

                 1
affiliation:           Senior Pathologists’ Assistant, University Health Network.

                      The author would like to thank Dr. Danny Ghazarian, Dr. Margaret Redpath, and Dr. Zoya Volynskaya
                                                                                          for contributions to this paper.

                             The author declares that there are no conflicts of interest regarding the publication of this paper.

   The author has provided CAP-ACP with non-exclusive rights to publish and otherwise deal with or make use of this
                   article, and any photographs/images contained in it, in Canada and all other countries of the world.

                                                    CASE PRESENTATION                                   Surgical History: childhood
                                                                                                        tonsillectomy.
                                                    The patient is a 53-year-old male who
                                                    found a small freckle in the left eye. The          Medical History: family history of
                                                    patient’s optometrist identified an intra-          malignant hyperthermia, smoker with
                                                    ocular mass after the patient complained            one previous ER visit for chest pain.
                                                    of three weeks of blurry vision.
                                                    Examination showed a choroidal mass                 Imaging Studies: ultrasound showed a
                                                    in the superior temporal quadrant of the            2.1cm elevated choroidal mass in the left
                                                    fundus with inferior retinal detachment             eye. CT of the chest, pelvis and abdomen
                                                    and subretinal fluid.                               showed no distant mets.
cáÖìêÉ=NK==bñíê~çÅìä~ê=jìëÅäÉë

Credit: OpenStax College [CC BY 3.0 (http://creativecommons.org/licenses/by/3.0)], via Wikimedia Commons.

                                                                        Revue canadienne de pathologie | volume 10, numéro 3 | www.cap-acp.org   17
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